Der Blinddarm dient als Reservoir für Bakterien die über Enzyme verfügen, welche der Mensch ansonsten nicht hat. Mit deren Hilfe ist es uns möglich auch die faserigen Bestandteile (zum Beispiel Cellulose) aus pflanzlicher Nahrung zu zersetzen. Diese Bakterien können von hier aus auch den Rest des Dickdarms besiedeln.

Der Blinddarm spielt eine wichtige Rolle im Immunsystem: Er beherbergt viele Zellen des Lymphsystems, das die Körperabwehr gegen Krankheiten darstellt. Zudem ist er Rückzugsgebiet für nützliche Bakterien. Werden Darmbakterien bei einer Infektion zerstört, überleben die „guten“ Keime im Blinddarm.

Wenn Darmbakterien bei einer Infektion zerstört werden, stellt der Blinddarm die rettende Insel für die „guten“ Keime dar und sichert so ihr Überleben. Nachdem die Krankheit abgeklungen ist, können diese sich wieder ausbreiten und die natürliche Darmflora konstruieren.